人体解剖学是阐述人体正常形态结构及其发生、发展的科学，是医学和生物学领域的重要专业基础课。学习人体解剖学的任务是使医学生理解和掌握人体各器官、系统的正常形态学特征和相互联系，以及人体各局部的组成结构、层次和毗邻关系，为基础医学和临床医学课程奠定坚实的形态学基础，以便正确地理解人体的形态结构与生理机能和疾病发生发展的关系，准确判断人体的正常与异常，区别生理与病理状态，对疾病进行诊断、治疗和深入研究。
北京协和医学院临床医学试点班的人体解剖学纵向课程是医学生从本科进入校本部学习所接触的一门专业大课，和器官-系统-功能的整合课相呼应，重点在通过解剖操作掌握人体各局部的重要解剖结构及其功能，实验课比重超过3/4。课程团队以基层-临床密切结合的“解剖学创新教学团队”共同参与教学，发挥协和“研究式教学”的传统特色，解剖实验课课实行分组教学，4个学生一组，课程内容全部实行网络化和多媒体化，以提高学习效率，为自主学习和终生学习提供最大程度的便利。课程中贯穿人文和素养教育内容，包括感恩遗体捐献者、团队协作等，课程结束后，每个学生完成2张解剖绘图和一份创意制作，并编辑成册留念。